Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nlrp1bA1Z198 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nlrp1bA1Z198 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms