Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4921501E09RikA0A0R4J054 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms