Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms