Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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