Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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