Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm25013-201ENSMUST00000158402 128 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC133203.2-201ENSMUST00000226709 464 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
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