Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PtprtQ99M80 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtprtQ99M80 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms