Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 BC035044-202ENSMUST00000178918 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Rpusd2Q149F1 Alcam-203ENSMUST00000164728 1885 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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Rpusd2Q149F1 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Rpusd2Q149F1 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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