Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Fyttd1-202ENSMUST00000120345 648 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Vmn2r13-201ENSMUST00000053253 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AC154573.1-201ENSMUST00000225913 4659 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PtprmP28828 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms