Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm11486-201ENSMUST00000107322 478 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Hoxd10P28359 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms