Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 1700063I16Rik-201ENSMUST00000194611 611 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr834-201ENSMUST00000086492 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Col5a3Q9JLI2 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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