Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RpainQ9CWY9 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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