Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm24507-201ENSMUST00000157683 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm45259-201ENSMUST00000209217 1006 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Traf3ip1Q149C2 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms