Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VdrP48281 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm26789-201ENSMUST00000181342 2502 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VdrP48281 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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