Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Prl3d1-202ENSMUST00000225330 866 ntAPPRIS P2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 AC154806.4-201ENSMUST00000227406 439 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm43329-201ENSMUST00000200120 3232 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
Ccl20O89093 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms