Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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Phf11bB4XVQ1 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Phf11bB4XVQ1 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Phf11bB4XVQ1 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Phf11bB4XVQ1 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms