Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms