Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Prl3d3-202ENSMUST00000223958 675 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Npy2r-201ENSMUST00000029633 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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Rabgef1Q9JM13 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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