Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps50-201ENSMUST00000209317 120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Smg9Q9DB90 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms