Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
NischQ80TM9 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
NischQ80TM9 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms