Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Gm44224-201ENSMUST00000204131 1463 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Ccdc18Q640L5 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms