Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr703-202ENSMUST00000216254 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Tsr1Q5SWD9 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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