Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Lrp2bp-203ENSMUST00000110381 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC150560.3-201ENSMUST00000227442 455 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Usp39Q3TIX9 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Usp39Q3TIX9 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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