Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms