Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm6812-201ENSMUST00000074894 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 1700020N15Rik-201ENSMUST00000075654 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Apobec3Q99J72 Gm14569-204ENSMUST00000169499 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms