Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 1700109K24Rik-201ENSMUST00000181870 1045 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Atg4aQ8C9S8 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Atg4aQ8C9S8 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Atg4aQ8C9S8 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Atg4aQ8C9S8 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Atg4aQ8C9S8 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Atg4aQ8C9S8 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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