Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Nlrc3Q5DU56 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Nlrc3Q5DU56 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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Nlrc3Q5DU56 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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Nlrc3Q5DU56 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm9373-201ENSMUST00000208724 599 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Nlrc3Q5DU56 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.6 ms