Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm23872-201ENSMUST00000175432 77 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Sh3bp1P55194 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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