Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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Hoxd10P28359 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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Hoxd10P28359 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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