Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Kcnj6-203ENSMUST00000165538 3637 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC134577.3-201ENSMUST00000226490 3000 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Hoxb2P0C1T1 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms