Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mipol1-203ENSMUST00000130447 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm23214-201ENSMUST00000122716 157 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm4904-201ENSMUST00000178243 1195 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Hdac5Q9Z2V6 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hdac5Q9Z2V6 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Hdac5Q9Z2V6 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Hdac5Q9Z2V6 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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