Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC160962.1-202ENSMUST00000225859 1116 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm37595-201ENSMUST00000192668 1742 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43789-201ENSMUST00000199275 2472 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Cx3cr1-202ENSMUST00000177637 3156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Rabgef1Q9JM13 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms