Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC165283.1-201ENSMUST00000223390 307 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm24789-201ENSMUST00000104282 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Usp27Q8CEG8 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 BC037156-201ENSMUST00000196993 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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Usp27Q8CEG8 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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Usp27Q8CEG8 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm24617-201ENSMUST00000116705 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm25778-201ENSMUST00000116713 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm25774-201ENSMUST00000116717 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm22102-201ENSMUST00000116730 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Usp27Q8CEG8 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms