Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm27781-201ENSMUST00000185185 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SmsP97355 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms