Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Vmn2r52-201ENSMUST00000164918 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PtprmP28828 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PtprmP28828 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Spp1-202ENSMUST00000086833 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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