Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd10P28359 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm15075-201ENSMUST00000122187 477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd10P28359 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms