Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37356-201ENSMUST00000193362 1613 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14410-202ENSMUST00000133301 1113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm22637-201ENSMUST00000158144 283 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Col5a3Q9JLI2 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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