Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Gm2381-201ENSMUST00000174558 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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RpainQ9CWY9 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RpainQ9CWY9 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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