Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm36382-201ENSMUST00000198892 541 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 6430511E19Rik-201ENSMUST00000192772 3835 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms