Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Aspa-201ENSMUST00000021119 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.4
Dsg1bQ7TSF1 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Dsg1bQ7TSF1 Gm22258-201ENSMUST00000177645 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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Dsg1bQ7TSF1 Gm22941-201ENSMUST00000179630 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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Dsg1bQ7TSF1 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Dsg1bQ7TSF1 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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