Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC131710.2-201ENSMUST00000226773 683 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10197-201ENSMUST00000086887 201 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Aadacl2-201ENSMUST00000169794 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm12447-201ENSMUST00000119110 470 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Oaz3-207ENSMUST00000204913 689 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm18908-201ENSMUST00000207125 1483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38156-201ENSMUST00000194601 2260 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Eppin-201ENSMUST00000103100 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms