Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Trafd1Q3UDK1 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1409-ps1-201ENSMUST00000194013 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms