Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PtpreP49446 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtpreP49446 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
PtpreP49446 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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PtpreP49446 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtpreP49446 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtpreP49446 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
PtpreP49446 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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PtpreP49446 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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PtpreP49446 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Malat1-201ENSMUST00000172812 6983 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Ankrd36-202ENSMUST00000109856 4491 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
PtpreP49446 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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