Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Mir680-3-201ENSMUST00000102298 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rpl28P41105 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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