Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28136-206ENSMUST00000189800 1104 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr307-201ENSMUST00000069279 1012 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm42583-201ENSMUST00000202678 6700 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Ccl20O89093 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms