Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
OtofQ9ESF1 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm38163-201ENSMUST00000194112 482 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm45415-201ENSMUST00000209644 2074 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm11196-201ENSMUST00000119052 395 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
OtofQ9ESF1 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms