Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Fcrl5-203ENSMUST00000178261 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC125484.1-201ENSMUST00000223218 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm2033-201ENSMUST00000210753 2287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp27Q8CEG8 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.7 ms