Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBW7

Chic1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chic1Q8CBW7 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Icosl-201ENSMUST00000105393 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm10482-202ENSMUST00000189825 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Limch1-203ENSMUST00000117601 3157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 L3mbtl3-202ENSMUST00000105519 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm42759-201ENSMUST00000195915 2439 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gabrb2-201ENSMUST00000007797 3989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm16226-201ENSMUST00000159950 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Mir3072-201ENSMUST00000175610 83 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm6054-201ENSMUST00000078052 378 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Aldoart1-201ENSMUST00000078617 2052 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 9430073C21Rik-201ENSMUST00000145346 2173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Tagap-201ENSMUST00000036370 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 CT025645.1-201ENSMUST00000222760 4322 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Srpx2-202ENSMUST00000113304 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm24327-201ENSMUST00000175108 78 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Mir8110-201ENSMUST00000183771 97 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm28376-201ENSMUST00000186604 176 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Oca2-201ENSMUST00000032633 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Grhl3-201ENSMUST00000105855 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Gm40841-202ENSMUST00000222823 3989 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Oprl1-201ENSMUST00000071585 2999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Chic1Q8CBW7 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm11189-201ENSMUST00000117979 375 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm12993-201ENSMUST00000119900 479 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 1700125H03Rik-202ENSMUST00000139265 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Chic1Q8CBW7 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms