Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gabpb2-204ENSMUST00000107209 8357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Eif4a2-224ENSMUST00000187168 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm43500-201ENSMUST00000201067 312 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms