Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Q3U6N9 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Q3U6N9 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Q3U6N9 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Pih1d3-201ENSMUST00000027230 1451 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Q3U6N9 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms